Пещера-источник Глиняная расположена возле истока реки реки Учан-Су (смотри: Учан-Су, родники на истоках. Каптаж 1904 года. Исток Учан-Су). Выход родника представляет собой узкое жерло пещеры в основании скалы, от пещеры вниз тянется небольшой, заваленный камнями овраг.